
拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC抗原丰度MHC举例联系肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到免疫力肽回文序列甚至英译后淡化相关信息,提高基因测序的真实度,并采用De novo上上下下测序技能,不依赖现有数据库,比较高通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且多种多样的数据报告研究內容为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!
图1 MHC-I和MHC-II呈递良性肿瘤抗原的经过
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例案具体分析
01 制度设计
好文章便秘尴尬检查经历:The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells
公布期刊杂志:Science Advances IF:11.7 2024
XPO1 (Exportin-1/CRM1)是种核输出的血清,在癌症晚期中老是过表示,做以为肺部肿瘤引发的动力因素分析。日前,靶向治疗XPO1的小大分子正被用于诊疗防癌用药。作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用天然免疫肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。
图2 某种出自于XPO1的肽是KIR2DS2的配体
02 良性肿瘤-免役治愈
内容题目的:Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors
提出自媒体:Nature Communications IF:16.6 2023
恶劣胸膜间皮瘤(MPM)是一种个种继发性恶意的侵扰性胃癌。仍然替换成的进行制疗预案欠缺明确疗效,由此十分困难需要新的进行制疗方法。长期以来其T细胞膜侵润,小说家举个例子MPM是一种个个应该的进行制疗性胃癌役苗的要求。迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用基本概念质谱的免疫性肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。
图3 恶性肿瘤胸膜间皮瘤免疫力肽组学论文检测
03 微生物mRNA接种疫苗规划设计
优秀文章题型:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes
提出月刊:Nature Communications IF:16.6 2023
单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过应用场景质谱的免疫性肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。
图4 在李斯特菌患上的Hela受损细胞核和HCT-116受损细胞核中认定MHC I呈递的抗原肽。
拜谱个人心得体会
免疫力系统力上皮体细胞系系性性设计肽组学是血清质组学的另一个迅速壮大的旁支,它专心于探讨免疫力系统力上皮体细胞系系性性设计设计中由主耍阻止相匹配性包覆体(MHC)或人类白癌上皮体细胞系系抗原(HLA)分子式呈递的免疫力系统力上皮体细胞系系性性设计肽。这部分免疫力系统力上皮体细胞系系性性设计肽是癌上皮体细胞系系面呈递的肽段,能够被T癌上皮体细胞系系辨别的,关键在于引起免疫力系统力上皮体细胞系系性性设计的反应。根据质谱的免疫力系统力上皮体细胞系系性性设计肽组学早已经成了监定MHC血清呈递肽的金标准化方式 ,能够一直监定不一样的人体生理和病理报告情况下下不一样的阻止和癌上皮体细胞系系多种类型中的免疫力系统力上皮体细胞系系性性设计肽组,比如实体型瘤或hiv病毒染病的癌上皮体细胞系系。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的球蛋白组学、分泌组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的免役肽组检查测量的服务,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,也可以准确无误且直观展示 抗体肽回文序列,得知比较多非典例抗体肽,落实责任挑选出靠得住新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。
分类论文文献
1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y