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Int J Mol Sci | m6A甲基化修饰对糖尿病小鼠认知功能障碍的调控机制

发布时间:2024-08-02
N6-甲基腺苷(m6A)是真核微生物体mRNA中偏关键的转录后修饰语,在真核微生物体的方面的问题和生物学环节中起着至关关键的意义。高血糖自我认知性障碍是种不不可逆转的交感精神精神系统性退行性妇科疾病,迄今为止未来发展确实切制度没有截然指出,如果由于缺乏效果的预防措施和开展的方式。

2024年2月6日,北京大学医学部联合首都医科大学附属北京朝阳医院在International Journal of Molecular Sciences上发表题为“Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice”的研究文章。研究人员探讨了高脂肪饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化的相关机制。该成果中拜谱生物技术为其提供m6A甲基化分析一下技術服务保障,为糖尿病小鼠高脂肪饮食诱导的认知功能障碍机制提供了新的线索。

经典文章名字大全:Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice(Int J Mol Sci.,IF=6.2,2024.2)

买家公司的:北京大学医学部、首都医科大学附属北京朝阳医院

研发建筑材料:小鼠脑组织

拜谱作为能力:m6A甲基化(MeRIP-seq)

提要图:

图1| 小结图(图源:Zhaoming Cao, et al., Int J Mol Sci., 2024)

论述结果显示

1.DCI小鼠海马中m6A人类基因呈现的提升

学习研究分析员工率先打造了高脂膳食和社会认知认知障碍(DCI)的小鼠型号。为相比之重相较比较组(n = 3)和DCI组(n = 3)规模内的m6A什么是染色体遗传体现,学习研究分析员工用MeRIP-seq确定了转录组规模内的m6A-seq研究分析。在DCI组的10664个编码查询什么是染色体遗传转录物(mRNAs)中共中央出现 相较比较组的23717个不偏移的m6A峰。相比之重之重,DCI组表面出23,757个非偏移m6A峰。在其中,9343个甲基化什么是染色体遗传在相较比较组和DCI组规模内偏移(图2)。

图2| 照表组和DCl组m6a掩盖DNA的维恩图

共评定出127八个对比剖析甲基化的m6A位点(DMMSs),在其中60.88%(778/1278)和39.12%(500/1278)的甲基化技术区分特殊高与相较比较组。剖析其生长图制作不均范围前提察觉m6A峰生长图制作不均范围在每个RNA中(图3A),并结合其生长图制作不均范围的转录区城涵盖如下五组:5'UTR、3'UTR、转录初始位点区城精彩场面、停止帐号秘码子精彩场面、初始帐号秘码子精彩场面和识别码队列(CDS)。m6A峰的在3'UTR、CDS和停止帐号秘码子旁边特殊聚集(图3B)。考虑到估评这类什么是人类基因上m6A呈现的区城,研究探讨成员建立了有峰参考文献标注的区城,并测试了这类什么是人类基因上reads的涉及率。在DCI组中,m6A呈现区侧重于3'UTR区(图3C)。每个mRNA内的DMMS都被定位系统到印染体上估评其生长图制作不均范围简况。多种小鼠印染体的m6A呈现谱多种。

图3| 小鼠海马中m6A甲基化图谱的改动

从而检验检测m6A淡化在DCI小鼠中的海洋生理学能力,探究人士从两队各写择含有DMMS的蛋清质编写代码什么是染色体组做好GO和KEGG定量探讨(图4A)。在GO定量探讨中,高甲基化什么是染色体组在上皮神经元环节、海洋怪物环节自我调节、离子液体亲水性和杂环化学物质紧密紧密配合中为同质性聚集。KEGG径路定量探讨界面体现 ,高甲基化什么是染色体组与T上皮神经元多巴胺蛋白激酶讯号灯径路、小上皮神经元肺腺癌和RIG-I样多巴胺蛋白激酶讯号灯径路关于(图4B)。相对于低甲基化什么是染色体组,GO定量探讨界面体现 在上皮神经元环节、产生环节和紧密紧密配合环节中为同质性聚集有机物环化学物质、紧密紧密配合杂环化学物质和离子液体亲水性(图4C)。KEGG径路定量探讨证明了低甲基化什么是染色体组与肥厚性心肌病和Hippo讯号灯径路的相互影响(图4D)。

图4| 对比甲基化m6A位点的通道生物富集

2.m6A MeRIP-Seq和RNA-Seq数据文件的合力了解

己经论述工作员将m6A MeRIP-Seq的数据探讨表格和仍然RNA-Seq的数据探讨表格开展共同探讨,遇到163个mRNA,m6A峰和mRNA品质方向重要发生变化。41种mRNA的m6A和mRNA品质方向调涨,14种mRNA品质方向再降。因此,30个人类什么是基因遗传mRNA表示调涨,m6A品质方向再降,73个人类什么是基因遗传mRNA表示再降,m6A品质方向调涨(图5A)。最后一步,创建一个PPIwifi网络来显示信息163个人类什么是基因遗传商品编码的蛋白酶两者的相连接(图5B)。

如下图所示6如下图所示,GO和KEGG深入研究氛围四组:(1) m6A上浮,mRNA再降;(2) m6A上浮,mRNA上浮;(3) m6A再降,mRNA再降;(4) dnam6A再降和mRNA上浮。在GO深入研究中,m6A上浮和mRNA再降的dna在血上皮感觉神经元基础分解基础消化吸收率转化环节、馥郁族无机化合物生态学组成环节和RNA基础分解基础消化吸收率转化环节的宏观调节管控中显著性丰度。KEGG深入研究表现,这种dna在脂肪酸上皮感觉神经元酸基础分解基础消化吸收率转化、小血上皮感觉神经元非小感觉神经元肺癌、丙酸基础分解基础消化吸收率转化和异丙醇酸基础分解基础消化吸收率转化中丰度。对待m6A上浮和mRNA上浮的dna,GO深入研究表现在亚铁紧密联系、亚胺丙氨酸脱羧酶亲水性、天冬氨酸1-脱羧酶亲水性和血上皮感觉神经元进行连接拆装负宏观调节管控中丰度;KEGG深入研究表现在2型尿毒症、脂肪酸上皮感觉神经元血上皮感觉神经元系数数据信息径路和胰岛素数据信息径路中丰度。在GO深入研究中,m6A再降和mRNA再降的dna在寡肽紧密联系、谷胱甘肽紧密联系和二硫被被氧化物质被被氧化完美重现酶亲水性中丰度,而在KEGG深入研究中,我们在青柠檬酸再循环往复(TCA再循环往复)、丙酸基础分解基础消化吸收率转化和多动物群凋亡中丰度。在GO深入研究中,m6A再降和mRNA上浮的dna在胚胎骨关节软骨要素产生、血清激酶亲水性解锁和NADP基础分解基础消化吸收率转化环节中丰度,在KEGG深入研究中,m6A再降和mRNA上浮dna在新霉素、卡那霉素和感觉神经菅养系数数据信息径路中丰度。

图5| m6A甲基化与mRNA展示的联合技术讲解

图6| 163个DEGs和DMMS的GO和KEGG定量分析

拜谱生物学个人心得体会

本研究表明高脂饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化。这些改变导致与神经退行性疾病相关的基因甲基化模式的改变,特别是在小鼠的海马区。这些发现为高脂肪饮食诱导糖尿病小鼠认知功能障碍的机制提供了新的见解,可能为糖尿病诱导的海马病变提供新的治疗策略。这一过程中拜谱生物体提供了m6A甲基化水平服务性,拜谱生物制品可提供完善成熟的蛋白酶组学、代谢率组学、转录组学及及几组学联席护肤品枝术售后服务,欢迎致电咨询!

选取资料:Cao Z, An Y, Lu Y. Altered N6-Methyladenosine Modification Patterns and Transcript Profiles Contributes to Cognitive Dysfunction in High-Fat Induced Diabetic Mice. Int J Mol Sci. 2024. doi: 10.3390/ijms25041990.

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