草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿体统最喜欢见的患病中的一种。肾机构中CaOx晶状体过饱合行成沉积会造成肾小管细胞系受伤和凋亡，为了造成肾结石的行成。短链碳水化合物酸由肠子内活性污泥革兰氏阴性菌发酵法饮食纤维板生成，并不是在部分区域肠子障壁中利用用，况且在体统技术上也利用重要用。这其中，丁酸是最充足的短链碳水化合物酸，兼具抗感染和免疫细胞治理和改善用,本探究浅析丁酸对CaOx肾结石的用还有风险靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山医院门诊泌尿整形外科吴忠专家教授、周子健硕士于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠教学、周子健硕士生在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱动物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了网洛药理学学服务项目，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

短文命名：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 业主方：华山大医院 设计女朋友：大鼠、HK-2人体细胞 组群个人信息：照表组（Con）、建模方法组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱提供数据技能：手机网络药学学探测

思维方案图

实验报告单

探索人士应先实现大鼠绘图，能够身体什么是生化要求和阻止疾病学染色法等探索方法得知丁酸都可以变少CaOx绘图大鼠肾CaOx结晶体的变成和板材损害，缓和CaOx绘图大鼠的宫颈炎症板材损害和钝化元素的太过传达。不但，丁酸还可减缓草酸诱骗的HK-2人体生殖细胞板材损害、钝化应激状态和人体生殖细胞凋亡。 为探究式丁酸形式和靶DNA在线，钻研员工从PubChem更改丁酸和丁酸酯的二维和3D形式（图1A）。顺利通过PharmMapper统计资料库和Uniprot统计资料库清理后共建立出115个丁酸靶DNA供进一歩概述。将DNA目录导进STRING统计资料库，来进行PPI在线概述。Cytoscape提供了编排的前20的核心区站靶DNA的简要在线图，其中包括CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。许多核心区站DNA与在线中的其它的DNA均现象出一些的有关于系性，说明书怎么写许多DNA将会利用着协同作战角色。GO和KEGG概述具体分析了丁酸核心区站DNA的有关于系条件和生物体工程学基本功能（图1C）。核心区站DNA包括与类固醇的激素类回话、硫化应激体现影响回话、抗逆性酶氧组织细胞对类固醇的激素类伤害性的影响相应对弱酸性耐腐蚀有机物的影响有关于。笔者认为说明，许多核心区站DNA包括参与的了硫化应激体现影响和对抗逆性酶氧的生物体工程影响整个过程，是肾结石进行原则中得尤为根本性的条件，这表达丁酸将会在肾结石中利用根本性角色。

图1| 丁酸形式与靶人类基因网络信息定量分析(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进三步打磨丁酸对CaOx肾结石真是切靶什么是表观遗传，探讨工作劳动力凭借GEO数剧库对GSE73680中建康差表与CaOx肾结石客户的什么是表观遗传差别的做好了探讨。差表组与CaOx结石客户的同质性性好别的抒发什么是表观遗传（DEGs）dna检测标准的为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共筛分到3783个什么是表观遗传情况同质性改变，至少3379个（89.4%）什么是表观遗传抒发上浮，404个（10.6%）什么是表观遗传抒发调低（图2A）。对DEGs做好聚类算法算法探索方案，热图界面显示了前10个被选中DEGs的二维分出层次聚类算法算法特性（图2B）。那么，探讨工作劳动力借助GeneCards数剧库劳动力认定了370个可能性与CaOx肾结石有关于的什么是表观遗传，排在前20位的預测什么是表观遗传和有关于性评分系统如图所示2C如图所示。成了找出丁酸医疗CaOx肾结石的根本靶点，探讨工作劳动力将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石有关于什么是表观遗传治理 获取一堆个Venn图。不可能，CYP2C9被选择为丁酸印象CaOx肾结石的内在的靶点(图2D)。显然，探讨工作劳动力还做好了丁酸与CYP2C9的原子核衔接，CYP2C9的三大氨基残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸彼此效用，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在灵活运用网洛药剂学学推测CYP2C9是丁酸反应CaOx肾结石的靶表观遗传后，调查人数还借助生殖上皮细胞试验查证了CYP2C9可拉低草酸帮助的HK-2生殖上皮细胞的ROS横向、真菌感染损坏和凋亡。

图2| 大部分据库协同分折预測CYP2C9是丁酸用处于CaOx肾结石的靶表观遗传

探析结局

本钻研前提看见丁酸在身体之外和人体内均能仰制CaOx肾结石模式的氧化物的应激性反应和真菌感染受损，很快使用网咯药学学学需求得以丁酸应响CaOx肾结石的不确定性靶点——CYP2C9，后使用癌细胞系测试印证CYP2C9在草酸盐促进的HK-2癌细胞系ROS水平方向、真菌感染受损和凋亡。以下看见显示丁酸能够使用仰制CYP2C9来仰制CaOx肾结石的氧化物的应激性反应，得到缓解真菌感染受损。某些步骤中拜谱微生态学展示 了网咯药学学学工艺水平服务管理保障，不仅拜谱微生态学可升高成孰完美的染色体组学、血清质组学、排泄组学等几组学食品及工艺水平服务管理保障，感谢致电的方式顾问！ 参阅资料：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.