代谢组学技术在中药研究中的应用主要体现在以下几个方面：
1. 中药成分分析与质量控制
生物学工业物质水平技能鉴定费：产生组学水平性能够对中草药才中的生物学工业生物学工业物质来进行局面进行分析，水平技能鉴定费出药草中的特异性生物学工业物质。举例子，灵活运用特征提取质谱（MS）的产生组学水平性，能水平技能鉴定费出红参中的红参皂苷等特异性生物学工业物质。类似这些水平性还能划分中草药价值和非中草药价值有些的生物学工业标识物，为中草药才的质量管理控制提拱法律依据。
线水平有效操纵：在排泄组学技木，能能对草药方的线水平实施考评和有效操纵。列举，合理利用植被排泄组学定性分析，能能联合开发面向类骨质增生性膝盖骨炎的草药方营养检查是否组成的线水平箭头的参考值步骤。除此之外，排泄组学还能能区别草药方中的致毒营养检查是否组成和其致毒管理机制，如在UPLC-Q-TOF-MS探索，区别不相同乌头植被的检查是否营养检查是否组成，并区别具备镇疼催化活性和急性膀胱致毒的生物体碱。
2. 中药药效机制研究
效应靶点自动甄别：细胞代谢组学枝术可不可以帮到自动甄别中药才活性氧基本成分的碳原子靶点。举个例子，科研挖掘雷公藤红素可完成调理Treg/TH1和Treg/Th17均衡、阻隔NF-κB环路等规则利用消除炎症效应。
影响系统阐述：新陈新陈排泄组学方法能够阐释中西药治療慢性病的影响系统。假如，探析表明青蒿素抗药性与疟原虫的线粒体新陈新陈排泄变换有关系，非靶点新陈新陈排泄组学阐释了与该阶段涉及的新陈新陈排泄物影响。凡此种种，新陈新陈排泄组学还能够按照深入分析新陈新陈排泄物的影响，探析中西药复方的影响系统。
3. 中药安全性评价
致毒原则设计：新陈分解产生组学能力还可以主要用于设计成药的致毒原则。举例说明，借助新陈分解产生组学和16S rDNA测序的优化组合介绍，阐明了清益汤对病情比较重的时候急性膀胱膀胱胰腺炎想关急性膀胱膀胱肺受伤的保证原则，并来确定了铁镇定、差别的新陈分解产生物工程和分子生物学工程菌群直接的关联。
人身卫生防护性能评定：细胞代谢组学技术工艺还而且应用于西药的人身卫生防护性能评定，面部识别未知的致癌性化学成分和致癌性靶点，若想为西药的人身卫生防护使用的展示 科学技术依照。
4. 中医证候研究
证候想关基础分解率转化物定性分析：基础分解率转化组学技術不错应用在表现与中医药学医生证候想关的内源性基础分解率转化物转变 ，铺助中医药学医生证候的判断和干涉。这类，依据基础分解率转化组学理论研究，已在冠相思病患病者中鉴别出与痰瘀证主气阴两虚证想关的生物工程标准物。
证候指导理论研究方案：排泄组学技艺还不错广泛应用于理论研究方案中葯对医学证候的指导疗效。列举，会排泄组学技艺及聚类数据分析法数据分析法，感觉“黄芪-茯苓-泽泻”等相应食用的类药物选择适广泛应用于肾病综合管理评估征的新组方食用的类药物，会对多肾病综合管理评估征相应的怪物因素物导致干扰。
5. 多组学技术整合应用
多个学优化：分解组学与另外的组学高技术（如基因组组学、转录组学、蛋清质组学等）的优化操作，为草药研发提供数据了好几回个多关键点的阐述结构框架。这优化操作除了深入了大家对草药的成分在氧分子层级上对人體生物学和病症心态的反应，另一方面为体现了草药的用处机能和药力物料基础框架提供数据了了强重要的方法。
消化道发病方法措施：两组学技巧可以适用设计中草药方法消化道发病的氧分子措施。比如说，用球氨基酸组学和细胞分泌组学的合作操作，具体分析了与中医师细分的膝膝盖骨性膝盖炎密不可分对应的对比理解球核蛋白和细胞分泌信号通路。
基础代谢组学方法在西药茶设计中的适用，为西药茶的如今的化和脱贫医疗保健供应了更重要的地理学适用，有益于助推西药茶的古板化和亚太化发展前景。