
2024年9月由无锡渔业大学专业张万刚博士生导师创业团队在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱微生物为该研究提供了亚硝基化装饰组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
常常版头:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
论文期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry
202几年后果指数:5.7
公布时候:2024年9月
老客户标准:南京农业大学
实验村料:蛋白
拜谱提高工艺:亚硝基化修饰组学
高技术线路:
一、调查最终
01.Caspase-3生物
目前为止尚不弄清楚NO对caspase-3的抑止的功效可否归因于NO介导的S-亚硝基化,各个氨水浓度等度的GSNO对于外源性NO销售,以诱发caspase-3的身体S-亚硝基化。导致体现了,与未GSNO的组相对,100、200和400μM GSNO组的caspase-3灵生物可观削减(图1),与之前新闻不一样。GSNO工作削减caspase-3灵生物的风险因为仍欠缺揭示。
图1 差异有机废气浓度的GSNO解决对caspase-3灵活性的干扰
02.Caspase-3的S-亚硝基化层次
调查Caspase-3的亚硝基化成度,以阐释GSNO对Caspase-3的化学反应性。经GSNO处理后,加测到caspase-3蛋白质S-亚硝基化強度加剧(图2)。这种最终表达,外源性GSNO塑造培养可取得成功诱导性caspase-3的身体S-亚硝基化。真让人难以相信的是,在没了GSNO会出现的较组中加测到一款较弱的S-亚硝基化带,这表达caspase-3也许 情况内源性的S-亚硝基化。与此同时,本调查中caspase-3的S-亚硝基化成度较高,而caspase-3的催化活性拉低,这与刚刚的调查相符。所以,caspase-3的活性聊天S-亚硝基化绘制位点尚不了解,还需要进一个步骤的经历。
图2 GSNO补救对caspase-3S-亚硝基化的水平的后果
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化淡化组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的队列。淡蓝色标上的队列数字代表S-亚硝基化肽,红色的标上的C数字代表S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱图
04.S-亚硝基化Caspase-3降解塑料结血清
结淀粉酶有所作为某种非常重点的人体上皮细胞骨架淀粉酶,在稳定肌人体上皮细胞结构的的的结构的的系统性和缩水性几个方面起着非常重点反应,深入分析S-亚硝基化caspase-3对结淀粉酶生物分解的铭理智存在非常重点现实意义。与Std(未用胱天淀粉酶酶-3和GSNO孵育的刚开始肌纤维板棉淀粉酶)组比起来,0 μM GSNO组(肌原纤维板棉和caspase-3的孵育,无GSNO)的系统结淀粉酶含碳量同质性降,提醒caspase-3对结淀粉酶存在存在的淀粉酶溶解工作能力。在GSNO孵育后,系统结淀粉酶的含碳量比较突出增强(P < 0.05)。除此之外,当GSNO密度身高时,系统结淀粉酶的含碳量连续上浮(P < 0.05)(图5)。这类发掘认为,SNO掩盖的caspase-3以水平方向根据的方式促使结淀粉酶的生物分解。
图5.S-亚硝基化caspase-3生物降解结蛋白质
05.S-亚硝基化Caspase- 3化学降解肌钙蛋白酶-T
肌钙血清-T (TnT)是原肌球血清改善责任人身体肌肉做收缩的丝条的有必要肌原合成氯纶血清。TnT的生物分解塑料功能是判断到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化时候下,caspase-3对TnT的生物分解塑料时候右图6提示,与Std组(不标caspase-3和GSNO的肌原合成氯纶)不同之处,caspase-3组中30 kDa TnT片断特殊增强,揭示caspase-3直接参与了TnT的生物分解塑料,凡此种种,caspase-3与GSNO的孵育造成30 kDa TnT才能减少。在100和200 μM GSNO组之前沒有判断到清晰的性别差异(P > 0.05),而当GSNO的质量浓度达到了400 μM 时,该片断特殊才能减少(P < 0.05)。这样的看到揭示了SNO呈现的caspase-3对TnT生物分解塑料的调控用处。结血清和TnT是caspase-3的灵敏底物,而GSNO除理降caspase-3的活力或许造成肌原合成氯纶血清生物分解塑料水平降。结合以上归结,NO诱惑的S-亚硝基化也可以凭借呈现半胱氨酸残基来改善caspase-3的活力,借以进两步关系其对结血清和TnT的血清溶解学习能力,才能关系牛羊肉品级。
图6. S-亚硝基化caspase- 3挥发肌钙核蛋白-T
二、个人总结
本实验有赖于探析S-亚硝基化对caspase-3装饰的危害简述随着对鸡肉肌原植物食物纤维身体之外生物降解的危害。蛋清S-亚硝基化能够 装饰caspase-3的半胱氨酸残基,因而引发caspase-3活性酶类降低,进三步缓和了其对鸡肉肌原植物食物纤维蛋清的蛋清蛋白质水解程度。三、拜谱工作小结
深入进行分析用到了酶活测试,亚硝基化绘制组学进行分析,WB等检验手法,看到球淀粉酶酶S-亚硝基化能能绘制caspase-3的半胱氨酸残基,这产生了caspase-3抗逆性的较低,并举每一步减缓了其对牛羊肉肌原氯纶球淀粉酶酶的球淀粉酶酶水解反应意识。本深入进行分析为释疑球淀粉酶酶质亚硝基化对肉嫩的控制机制化能提供半个个新的画面。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的血清质组学、呈现血清质组学、新陈代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸型号车辆,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺硝化作用、total防氧化修复、游离于巯基,欢迎大家咨询!
符合学术论文:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663