
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱海洋生物 为其提供 TMT核蛋白组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
研究分析后果
设计人探究性随着时推移冷冻箱时加长羊肉的硬性、持混流式水轮机、光滑、阳极氧化钙含氧量铁含氧量、ROS、脂质过阳极非金属氧化物、MDA、GSH和GPX4能力素质来分析相关肌肉阻止生殖组织细胞的铁致死阶段。效果信息显示,冷冻箱时加长后,羊肉的硬性在第5天和第6天明显下滑;持水能力素质下降;色调变深,有了光滑,鲜大灰色变的暗大灰色。不仅如此,阳极氧化钙含氧量铁、活性酶类氧和MDA的含氧量明显加剧,生殖组织细胞凋亡率明显提高。 研究研究考生去除多种冰箱时长的肌群土样的蛋清质,最后使用SDS-PAGE研究,蛋清质条带在多种时段布置粗糙且相仿(图1a)。利用蛋清在多种土样中的理解状态,研究会发现一个组土样的中六位数取决于于一个质量(图1b),反映肌群土样蛋清质具充分的组内相仿性和组间不同性。 营养物质质组学共认定出1996种营养物质质。以B0为照表组,挑选B1、B2、B4和B6中的营养物质完成对比概述形容概述,共认定到37七个DEPs。将火山图信息可视化,并按照FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两大基准概述DEP。结杲体现1c-f体现,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中别认定出22、33、73和140个DEPs,这里面别调整6、11、32和86个,降低16、22、41和5两个。聚类分析最简单的方法风险评估了有所不同保鲜分阶段胸肌组织机构中营养物质质的形容,结杲屏幕上显示胸肌营养物质形容对比概述由于贮存日期的加剧而加剧(图1g)。
图1| 不一样的冷冻箱时期的肌肉组织备样淀粉酶质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 有所不同冷冻冷藏日子的力量图纸差别球蛋白阐述(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁枯死蛋清肽的PRM定量分析一下分析一下(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 源于KEGG丰度区别表现血清的铁死亡者制度化(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结ppt
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱动物提供了TMT参考值氨基酸质组学新的技术的售后服务,拜谱怪物已科研完工并构建了熟熟的转录组学、氨基酸组学、分解组学相应多个学连合货品新的技术的售后服务安全体系,欢迎致电咨询!
参考价值文章:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.